某日，小新（矢島晶子 配音）、小葵和美伢（楢橋美紀(jì) 配音）被一群神秘人物綁架，醒來之后發(fā)現(xiàn)身處一間神秘的基地之內(nèi)，原來，這里是名為“溫泉G組”的秘密組織，意在保護(hù)對于日本來說十分珍貴的溫泉。然而，橫空出世的污垢達(dá)人博士（家弓家正 配音）企圖利用“地球溫泉計(jì)劃”將溫泉G組徹底擊垮?！　∥ㄒ荒軌蜃柚刮酃高_(dá)人博士的陰謀的，就只有僅存在于傳說之中的“黃金之魂溫泉”，而組員們經(jīng)過調(diào)查，發(fā)現(xiàn)該溫泉正好處于小新...

小新在河邊無意間撿到一顆彈珠，看它很閃亮于是就撿回家里。沒想到卻被小葵吞進(jìn)肚子里。這下糟了，原來這顆彈珠是珠由良族與珠黃泉族在爭奪的魔人賈克的珠珠，珠黃泉族的首領(lǐng)玉王想要利用賈克的魔力征服世界。就這樣，小新一家人卷入兩族人的爭奪戰(zhàn)中，小葵被玉王綁架走了，大家為了保護(hù)小葵，費(fèi)盡心力…最后平安的救出小葵，小新卻在無意間，將兩顆珠珠放進(jìn)封印賈克的人俑里，魔人賈克被釋放出來了.........

某日，雙葉幼稚園的孩子們正在船屋里愉快的玩耍，一位名叫美色（三石琴乃 配音）的神秘人物忽然現(xiàn)身，緊接著，一艘巨大的飛船將船屋整個(gè)抓了起來，來不及逃跑的風(fēng)間（真柴摩利 配音）和小新（矢島晶子 配音）等人和飛船一起消失在了空中?！　⌒⌒碌氖й櫫蠲镭螅A橋美紀(jì) 配音）和廣志（藤原啟治 配音）感到十分焦急，就在此時(shí)，一名代號肌肉（玄田哲章 配音）的男子出現(xiàn)在了兩人的身邊，很顯然，肌肉知道小新的下落和整件事...